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肖百龍解讀諾貝爾獎:Piezo的發(fā)現(xiàn)故事和未解之謎
原創(chuàng) 肖百龍 返樸
要充分信任自己的學(xué)生、博士后,給予他們充分的時間和環(huán)境去大膽嘗試。
受訪 | 肖百龍(清華大學(xué)藥學(xué)院教授)
采訪 | Idobon
2021年的諾貝爾生理學(xué)或醫(yī)學(xué)獎頒發(fā)給了美國生理學(xué)家David Julius與亞美尼亞裔美國神經(jīng)科學(xué)家Ardem Patapoutian,以表彰他們發(fā)現(xiàn)了溫度覺和觸覺的受體(“for their discoveries of receptors for temperature and touch”)。神經(jīng)科學(xué)領(lǐng)域再次受到學(xué)界和大眾的高度關(guān)注。
其中,Ardem實驗室首次鑒定了哺乳動物中感受機械力的陽離子通道Piezo家族,并發(fā)現(xiàn)它們在觸覺、本體感知等方面的重要作用。當(dāng)時,清華大學(xué)藥學(xué)院教授肖百龍正在美國斯克利普斯研究所(The Scripps Research Institute)跟隨Ardem Patapoutian教授從事神經(jīng)科學(xué)博士后研究,見證并參與了這項偉大的科學(xué)發(fā)現(xiàn)?!斗禈恪吩陬C獎后的第一時間采訪到肖教授,請他為我們講述Piezo蛋白背后的科研故事和將來的探索方向。
返樸:您在Aderm 實驗室做博后期間,見證了Piezo蛋白的發(fā)現(xiàn)??梢越榻B一下這個發(fā)現(xiàn)背后的故事嗎?
肖百龍:2007年,我到Ardem實驗室做博后,那時他們正在做溫度門控的離子通道,也就是溫度的分子受體的鑒定發(fā)現(xiàn)與研究。他們已經(jīng)報道了幾個溫度感知的分子受體,有感受涼爽的離子通道TRPM8,感知溫?zé)岬腡RPV3和感知冷的TRPA1。當(dāng)時Ardem還是副教授,實驗室充滿活力,感覺很有前景,我也因此選擇了加入這個實驗室,做一些與溫度感知相關(guān)的工作。
那時,隨著TRP家族的發(fā)現(xiàn),溫度感知已經(jīng)取得很多突破。但在感知領(lǐng)域還有個大家都很關(guān)注的、非常重要的問題還沒有解決:是什么蛋白分子介導(dǎo)了機械力的感知?換言之,觸覺系統(tǒng)的分子基礎(chǔ)還是未解之謎。當(dāng)時領(lǐng)域內(nèi)許多實驗室,包括David Julius 實驗室,都在尋找這個蛋白分子。
但機械力感知的研究很困難,沒有高通量的篩選方法,只能用電生理技術(shù)對單個細(xì)胞施加機械力刺激,讓它產(chǎn)生電流,來尋找相關(guān)的分子。這個技術(shù)非常有難度,實驗室還沒有人專門投入到機械力敏感離子通道的篩選工作上。到了2007年下半年,Ardem實驗室招收了一個博士后叫Bertrand Coste。Bertrand在法國接受了三年的博士訓(xùn)練,主要工作就是記錄背根神經(jīng)節(jié)的機械敏感電流,有非常扎實的電生理技術(shù),和Ardem的需求非常匹配。
Bertrand篩選離子通道的策略是:
1. 先篩選細(xì)胞系,看哪些細(xì)胞系會產(chǎn)生機械敏感的電流。他發(fā)現(xiàn)N2A細(xì)胞能響應(yīng)機械力,產(chǎn)生內(nèi)向電流。
2. 然后利用RNA profiling技術(shù),找到N2A細(xì)胞中高表達(dá)的膜蛋白(兩次跨膜以上)編碼基因,共確定了500多個候選基因。
3. 接著便是對這些基因逐一敲低(knock down)。這是一項高度重復(fù)的艱苦工作,最終在第72個候選基因上,找到了決定N2A細(xì)胞機械敏感電流的基因,F(xiàn)AM38a。后來根據(jù)希臘語,將這個蛋白命名為“Piezo”,意思是壓力。
Piezo蛋白的電生理篩選過程示意。用黑色針頭戳細(xì)胞膜(施加機械力刺激),在另一側(cè)用玻璃電極記錄細(xì)胞膜上的電流變化。細(xì)胞膜受力后,Piezo通道打開,陽離子流入細(xì)胞,玻璃電極即可記錄到內(nèi)流電流。Bertrand Coste先用這一方法找到了Piezo1,又根據(jù)序列同源比對找到了Piezo2。丨來源:https://www.nobelprize.org/prizes/medicine/2021/press-release/Bertrand大概花了三年時間,成功找到了感受機械力的蛋白,要總結(jié)一些成功要素的話,最重要的是他的電生理訓(xùn)練非常扎實,實驗工作非常嚴(yán)謹(jǐn)。但回頭來看其實也有一定的運氣成分。一方面,根據(jù)篩選策略,Piezo蛋白在N2A細(xì)胞里是高表達(dá),而在對照組細(xì)胞C2C12細(xì)胞里應(yīng)該是低表達(dá),但實際情況并不符合設(shè)想的模式。實際情況是Piezo蛋白——我們后來知道是Piezo1——在C2C12細(xì)胞里的表達(dá)比N2A細(xì)胞中更高。另一方面,有500多個備選基因,Bertrand能在第72個就找到,實屬幸運。如果目標(biāo)在后面,那可能就要花五六年的時間去找,很難說能否堅持下去。
返樸:三年找一個蛋白,Bertrand想必壓力很大。當(dāng)時他是怎么應(yīng)對的呢?Ardem作為導(dǎo)師又是什么態(tài)度呢?
肖百龍:Bertrand在這個課題進(jìn)展過程中的確承受著很大壓力。當(dāng)時我的課題是鑒定一個新的溫度感知受體,有了一定進(jìn)展,那時候Bertrand還沒鑒定出Piezo,我們就討論可以一起合作研究這個新型的溫度受體,這樣萬一鑒定工作不順利,Bertrand也能有論文,對他的職業(yè)生涯有幫助。但一段時間后,Bertrand成功篩選到了Piezo1。后續(xù)的實驗證實,敲低Piezo1可以使N2A細(xì)胞喪失感知機械力的能力,而且在其他對力不敏感的細(xì)胞——比如HEK293T細(xì)胞中——過表達(dá)Piezo1,能使HEK293T細(xì)胞獲得機械敏感性。這就完全證實了他的發(fā)現(xiàn):Piezo1基因是編碼介導(dǎo)機械敏感陽離子電流的必要與充分組成成分。
這個發(fā)現(xiàn)出來以后,Bertrand, Ardem以及實驗室成員都很興奮,大家都意識到這是一個非常重要的突破,整個實驗室也從溫度受體迅速轉(zhuǎn)向,投入到Piezo的研究中。
Ardem的實驗室環(huán)境總體是非常寬松友好,大家效率也很高,壓力主要來自我們自己。而Ardem則非常包容,給大家足夠的信任,讓大家自由探索。我從Ardem身上也學(xué)到了這一點,要充分信任自己的學(xué)生、博士后,給予他們充分的時間和環(huán)境去大膽嘗試。當(dāng)然,Ardem實驗室主要都是經(jīng)過良好學(xué)術(shù)訓(xùn)練的博士后,大家有足夠的學(xué)術(shù)積累和技術(shù)特長去主導(dǎo)自己的課題。
返樸:Piezo蛋白和我們的健康究竟有哪些關(guān)系?
肖百龍:Piezo家族有兩個成員,一個是Piezo1,一個是Piezo2。Piezo2直接和我們的觸覺感知相關(guān)。正常人的撫摸、擁抱、使用各種工具,比如觸摸手機屏幕,都需要Piezo2的參與。還有“本體覺”,就是我們自身的肌肉狀態(tài),比如走路時保持平衡,是因為神經(jīng)系統(tǒng)中的Piezo2能監(jiān)測到肌肉的整張度。另外,我們的內(nèi)臟器官的機械變化,譬如血壓、呼吸、膀胱充盈度等也被Piezo2所監(jiān)控。
已有非常明確的遺傳學(xué)證據(jù)表明,如果Piezo2突變或者缺失,會引發(fā)明顯的觸覺缺陷,病人對震動、觸碰的敏感性會顯著降低。另外,本體感覺能力會受到很大影響,例如,蒙住病人的眼睛,屏蔽視覺信息,病人就走不穩(wěn)路,摸東西也摸不準(zhǔn)。甚至還會導(dǎo)致骨骼系統(tǒng)變形,例如,脊柱中正是因為兩側(cè)肌肉牽拉,張力平衡,而缺失Piezo2的病人無法感受肌肉張力,兩側(cè)肌肉就會失去穩(wěn)態(tài),導(dǎo)致脊柱發(fā)生嚴(yán)重的彎曲、變形。還有,病人會因為不能感知膀胱充盈度而出現(xiàn)泌尿異常。
Piezo2介導(dǎo)了觸覺的感知,在人的機械痛、排尿、呼吸、血壓、骨骼重塑等生理過程中起著重要作用。來源丨h(huán)ttps://www.nobelprize.org/prizes/medicine/2021/press-release/Piezo1的表達(dá)就很廣泛了。比如心血管系統(tǒng),Piezo1在血管內(nèi)皮細(xì)胞、紅細(xì)胞、上皮細(xì)胞、心肌細(xì)胞上都有表達(dá),起著很重要的作用。有一種疾病就是由Piezo1功能太強導(dǎo)致的,會造成紅細(xì)胞變形,令其攜帶氧氣的功能發(fā)生紊亂,造成貧血。而Piezo1缺失則會導(dǎo)致淋巴管水腫、胚胎流產(chǎn)等癥狀。
我們自己的工作發(fā)現(xiàn),Piezo1在心肌細(xì)胞里表達(dá),參與感知心臟收縮舒張所產(chǎn)生的劇烈機械變化,從而調(diào)控心臟穩(wěn)態(tài);心臟病患者的Piezo1表達(dá)會出現(xiàn)上調(diào)。我們與合作者還發(fā)現(xiàn),Piezo1對骨的生成和重塑非常重要。長期臥床或在太空失重會導(dǎo)致嚴(yán)重骨質(zhì)丟失,而骨骼之所以能感受到重力,是因為成骨細(xì)胞中表達(dá)了Piezo1。當(dāng)我們從小鼠中敲除Piezo1,小鼠會出現(xiàn)嚴(yán)重的骨質(zhì)丟失;而骨質(zhì)丟失病人的體內(nèi),Piezo1表達(dá)下調(diào)了。
返樸:也就是說,雖然這次諾獎的發(fā)獎理由使用的“touch”這個詞,媒體報道為觸覺,但其實“touch”并不是簡單的“手摸到了什么東西”,它其實非常廣泛,甚至是每個細(xì)胞對力的感知,可以這么說嗎?
肖百龍:對!從力學(xué)的角度來說,只要有接觸就會有力的產(chǎn)生,因此只要有接觸就會造成力的感知,這個感知很有可能就是通過Piezo通道來介導(dǎo)的。Piezo2主要和觸覺、本體覺、內(nèi)臟覺機械力感知相關(guān),而Piezo1則在機體的很多細(xì)胞組織中都存在。有研究發(fā)現(xiàn)它在癌細(xì)胞里也有表達(dá),對癌細(xì)胞的增殖與轉(zhuǎn)移起著重要作用,因為癌細(xì)胞的遷移也會涉及到力的感知。從這個角度來說,Piezo通道的功能非常廣泛,因而也是無比重要的。
返樸:您在Ardem 實驗室參與了Piezo最初的重要工作,成為獨立PI后,又做出了很多推動性成果,可以介紹下您和其他實驗室在Piezo領(lǐng)域的重要成果嗎?
肖百龍:2010年Ardem實驗室在Science上報道了Piezo蛋白介導(dǎo)機械力感知以后,就有很多后續(xù)問題等待解決。這個基因編碼的蛋白非常獨特,有2500個氨基酸,預(yù)測有30~40次跨膜,是人類蛋白中跨膜次數(shù)最多的一類膜蛋白,而且與已知的其他電壓門控離子通道——例如鈣通道、鈉通道、鉀通道或溫度敏感TRP通道(譬如這次獲獎的另一主角TRPV1)——沒有任何序列上的類似性。因此2010年的這篇文章只能下結(jié)論說Piezo是力感知器的重要組成部分,但不能確定它是直接感受機械力的成孔離子通道。畢竟還存在著另外一種可能性,Piezo蛋白可能是成孔亞基的輔助亞基,賦予機械敏感性。
為了解決這個問題,Bertrand和我展開了合作。我在博士期間做過蘭尼堿受體(Ryanodine receptors)的生化、結(jié)構(gòu)、功能研究,對大型膜蛋白有很好的研究背景。于是我第一個把Piezo1蛋白重組表達(dá)純化出來,證明它形成多聚體,并組裝在脂雙層上。我們發(fā)現(xiàn)在沒有其他任何細(xì)胞成分的人工膜環(huán)境下也能記錄到陽離子電流存在,證實了Piezo1是一類全新的感受機械力的離子通道。這篇文章2012年發(fā)表在Nature上,我和Bertrand是共同一作。這就是我早期在Ardem實驗室參與的工作。
Piezo通道這類全新機械門控離子通道家族的發(fā)現(xiàn)和確立帶來了很多契機。一方面,需要證明它的病理、生理功能的重要性,通過在小鼠、果蠅、斑馬魚等模式動物上敲除這個基因,看看會發(fā)生什么表型改變。另一方面,這個離子通道在分子機制上是怎么工作的?換言之:Piezo通道蛋白怎么將機械力刺激轉(zhuǎn)化為離子的選擇性通透、轉(zhuǎn)化為電信號?這是一個核心問題。
2013年1月,我在清華組建了自己的課題組。
我們知道2013年程亦凡和David Julius合作用冷凍電鏡解析了TRPV1的原子分辨率的結(jié)構(gòu),而Piezo蛋白是一個非常復(fù)雜的全新蛋白,如果不了解它的結(jié)構(gòu),要去研究它的機制會非常困難。因此我決定改變研究范式,先獲得結(jié)構(gòu),再做功能機制研究,這樣會更加高效。基于我自己的研究背景、利用在哺乳動物細(xì)胞系HEK293T細(xì)胞里重組表達(dá),我們拿到了純化的Piezo1蛋白。當(dāng)時恰逢清華在建立冷凍電鏡平臺,我們實驗室最初與高寧、楊茂君合作,之后與李雪明課題組長期合作,取得了Piezo1蛋白的中等分辨率和接近原子級別的高分辨率結(jié)構(gòu)(Nature 2015, Nature 2018),建立了它同源三聚體、螺旋槳狀的結(jié)構(gòu),搞清楚了離子通道最核心的孔道區(qū)在什么地方,與機械力感覺相關(guān)的結(jié)構(gòu)域等。
在我們于2015年報導(dǎo)了Piezo1的首個中等分辨率結(jié)構(gòu)后,我們實驗室(與李雪明實驗室合作)、Ardem實驗室和Roderick MacKinnon(2003諾貝爾化學(xué)獎得主——記者注)實驗室大約在同一時間解析出了Peizo1蛋白的高分辨率結(jié)構(gòu)。我們和Ardem的文章背靠背發(fā)表在Nature上,MacKinnon則發(fā)在eLife上。
相比Peizo1的結(jié)構(gòu)研究,Peizo2的分子生化更難。我們和李雪明課題組合作,首次、唯一報道了Peizo2的完整結(jié)構(gòu),確定了它的每個亞基包含38個跨膜區(qū)的完整拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)。這為我們研究Peizo2離子通道、感受機械力的分子機制提供了重要的線索。據(jù)此,我們進(jìn)一步開展了大量的基于結(jié)構(gòu)導(dǎo)向的結(jié)構(gòu)功能研究,揭示了Piezo通道的離子通透、機械門控的分子機制。
Piezo2的蛋白結(jié)構(gòu)圖。丨供圖:肖百龍除了分子機制方面的研究,還有藥物工具分子的篩選發(fā)現(xiàn)。由于Piezo是全新的離子通道家族,因此與溫度敏感離子通道TRPV1以及其他電壓門控離子通道相比起來,它的藥物工具非常匱乏。Ardem通過高質(zhì)量的篩選,篩選到了一個小分子Yoda1;我們在清華也做了自己的篩選,篩選出兩個藥物小分子Jedi1/2,能夠激活Piezo1,我們也進(jìn)一步研究了這些小分子藥物的激活機制。
目前看來,在生理病例功能方面,Ardem實驗室做了大量重要的發(fā)現(xiàn),而在分子機制方面我們實驗室做出了重要的貢獻(xiàn)。
返樸:大家對Piezo家族已經(jīng)取得很多認(rèn)識,下一步重要的待解決問題是什么?還有哪些重要的工作要做?
肖百龍:我認(rèn)為有三個方面。第一,Piezo通道怎么把機械力轉(zhuǎn)成電信號,這個核心問題還沒有完全解決。現(xiàn)在已經(jīng)有一些進(jìn)展,但還處于假說階段,還需要更多結(jié)構(gòu)功能方面的研究。例如,我們現(xiàn)在拿到的還只是Piezo通道在關(guān)閉狀態(tài)的結(jié)構(gòu),那它到底是怎樣在受力以后變成開放狀態(tài)的呢?這中間的動態(tài)的過程是怎樣的?其實,包括TRPV1,到底是怎么感知溫度引起通道開放的,現(xiàn)在也還是沒有解決的問題。而TRPV1從1997發(fā)現(xiàn)到現(xiàn)在已有20多年了,這個核心問題一直還沒有解決。
第二,Piezo通道現(xiàn)在已經(jīng)被報道具有非常廣泛的生理病理功能。但是絕大多數(shù)的工作都是在敲除體系下的表型描述,具體Piezo到底是怎樣利用它的機械敏感性、離子信號,來調(diào)控相關(guān)的生理病理功能,都還有待更深入的研究。
第三,針對Piezo通道的藥物發(fā)現(xiàn)與開發(fā)?,F(xiàn)在已經(jīng)明確Piezo2和觸摸超敏痛密切相關(guān),且Piezo2的表達(dá)集中在外周感覺神經(jīng)元,那么針對Piezo2的藥物設(shè)計有著非常大的前景。但是由于Piezo通道分子生化研究的困難性,藥物研發(fā)方面還有待突破,這也是我們實驗室的一個長期研究目標(biāo)。
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原標(biāo)題:《肖百龍解讀諾貝爾獎:Piezo的發(fā)現(xiàn)故事和未解之謎》
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