7月26日，國家蛋白質(zhì)科學研究（上海）設(shè)施迎來開放十周年。

作為全球首個生命科學領(lǐng)域的綜合性大科學裝置，蛋白質(zhì)設(shè)施現(xiàn)有九大技術(shù)系統(tǒng)，建立了從蛋白質(zhì)樣品制備、結(jié)構(gòu)解析到功能研究的完整技術(shù)體系。面向未來，蛋白質(zhì)設(shè)施全面加速傳統(tǒng)實驗技術(shù)與AI技術(shù)的深度融合。

國家蛋白質(zhì)科學研究（上海）設(shè)施開放十周年學術(shù)論壇。主辦方 供圖

2010年開工建設(shè)，2015年正式開放，蛋白質(zhì)設(shè)施始終面向人民生命健康領(lǐng)域的重大需求，聚焦基礎(chǔ)研究、前沿交叉和生物醫(yī)藥產(chǎn)業(yè)轉(zhuǎn)化關(guān)鍵環(huán)節(jié)，持續(xù)為生命科學重大科研任務(wù)提供高水平技術(shù)支撐。

開放十年來，蛋白質(zhì)設(shè)施已服務(wù)全國33個省級行政區(qū)的504家科研單位（含100多家科技企業(yè)），支撐超過2500個研究團隊、累計10萬余人次用戶開展實驗研究。設(shè)施支撐完成科研課題超13400項，發(fā)表高水平研究論文4000余篇，包括《自然》《科學》《細胞》等國際頂級期刊學術(shù)論文136篇。

十年來，蛋白質(zhì)設(shè)施作為我國蛋白質(zhì)科學研究“國之重器”，始終致力于推動蛋白質(zhì)科學技術(shù)的升級與創(chuàng)新。蛋白質(zhì)設(shè)施建設(shè)的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫，支撐起我國生命科學數(shù)據(jù)的開放共享，實現(xiàn)了中國機構(gòu)參與國際蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫（PDB）建設(shè)和管理的“從0到1”突破。截至2025年5月，PDB共收錄235666條高質(zhì)量蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)，其中約10.3%來自中國地區(qū)的投遞，位于蛋白質(zhì)設(shè)施的中國團隊已累計注釋審校數(shù)據(jù)條目超過6000個。

國家蛋白質(zhì)科學研究（上海）設(shè)施

面向人工智能時代的深度演進，科學研究正步入以數(shù)據(jù)驅(qū)動和模型預(yù)測為特征的“AI for Science”新時代。蛋白質(zhì)設(shè)施正全面加速傳統(tǒng)實驗技術(shù)與AI技術(shù)的深度融合，以智能化、自動化、體系化的技術(shù)升級路徑，推動核心實驗平臺向更高通量、更高維度、更強融合的方向演進，打造支撐未來蛋白質(zhì)科學發(fā)展的關(guān)鍵“底座”型科技基礎(chǔ)設(shè)施，夯實我國在生命科學與生物技術(shù)領(lǐng)域的全球競爭力。

應(yīng)對新一輪科技革命的技術(shù)挑戰(zhàn)，蛋白質(zhì)設(shè)施正系統(tǒng)布局蛋白質(zhì)動態(tài)結(jié)構(gòu)研究平臺建設(shè)，著力提升設(shè)施整合結(jié)構(gòu)生物學平臺實時捕捉動態(tài)結(jié)構(gòu)的時間分辨能力，同時引入AI驅(qū)動的模擬計算與構(gòu)象預(yù)測技術(shù)，推進功能蛋白質(zhì)動態(tài)結(jié)構(gòu)的多尺度、多時間點計算模擬能力。

在合成生物學這一“AI+生物”最活躍的領(lǐng)域，蛋白質(zhì)設(shè)施也正在積極布局智能蛋白質(zhì)設(shè)計與制造平臺。結(jié)合生物分子結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫、AI算法創(chuàng)新和自動化合成技術(shù)，設(shè)施將對PDBc數(shù)據(jù)庫與計算框架進行升級，并攜手康碼（上海）生物科技有限公司，聯(lián)合打造全球首個高通量的“DNA-to-Protein蛋白質(zhì)體外無細胞合成”智能制造裝置。

以結(jié)構(gòu)生物學為錨點，蛋白質(zhì)設(shè)施全面擁抱智能計算、機器學習與高性能模擬技術(shù)，推動結(jié)構(gòu)測定與功能設(shè)計的深度融合，打造“從結(jié)構(gòu)認知”到“結(jié)構(gòu)創(chuàng)造”的全新國家大科學設(shè)施新生態(tài)。

面向未來，蛋白質(zhì)設(shè)施將持續(xù)錨定國際科技前沿和國家戰(zhàn)略需求，著力構(gòu)建結(jié)構(gòu)生物學與合成生物學交叉融合的技術(shù)新體系。設(shè)施將聚焦蛋白質(zhì)動態(tài)結(jié)構(gòu)研究這一全球挑戰(zhàn)性方向，升級關(guān)鍵實驗系統(tǒng)，攜手高性能計算平臺共建“干濕結(jié)合”的動態(tài)研究生態(tài)，打造支撐新藥發(fā)現(xiàn)和功能分子設(shè)計的基礎(chǔ)能力。同時，面向人工智能時代的合成生物學新機遇，設(shè)施將推動“蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫”與“設(shè)計平臺智能化重構(gòu)”，建設(shè)全球首個高通量蛋白質(zhì)“智造”平臺，為我國率先占領(lǐng)生命科學技術(shù)制高點注入強勁動能。